Ez az egyik legdrágább vasúti reláció Magyarországon
A Budapest-Szombathely vasútvonalon oda-vissza ezer forinttal kell többet fizetni azokhoz képest, akik hasonló távolságra, például Pécsre utaznak a fővárosból. Kétszer is próbálkozott már egy szombathelyi szocialista képviselő, hogy a GYESEV-vonalakon utazókat érintő hátrányok megszüntetését elérje. Ipkovich György szerint ugyanis igazságtalan, hogy ha valaki Szombathelyről Budapestre utazik, akkor nem érvényesek rá a hosszú távú közlekedéssel járó kedvezmények, mert külön jegyet kell váltaniuk a MÁV- és külön a GYESEV-szakaszra. A gyorsvonati pótjegy bevezetésével pedig tovább nő a különbség.