A Biokontroll Hungária ellenőrzési, nyilvántartási díjat szed a tanúsításért, függően, hogy termelésről, feldolgozásról, vagy értékesítésről van szó. Mezőgazdasági tevékenység esetén az elszámolás alapja a művelésbe vont terület nagysága. Tavaly 1389 termelőt, 402 feldolgozót és 8 importőrt tartottak nyílván.