A klímaváltozás miatt jóval később térülhet meg Paks II.
Főleg, ha Paks I.-et meghosszabbítják, és együtt fognak üzemelni. A hatások összeadódnak, a Dunán komoly ökológiai problémákat vethet fel a dupla adag kiengedett hűtővíz. A legnagyobb probléma az átláthatóság hiánya.